12年國教從規畫至上路後爭議不斷，
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，監委調查發現，
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，教育部未善盡督導各學區高中職入學辦理作業，
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，導致時程逾期，
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，並延誤104年入學作業，
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，影響學生學習權益，
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，顯有重大違失，
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，監院因此於昨天通過監委王美玉等人提案，糾正教育部。教育部國教署長吳清山回應，尊重監察院，會針對糾正內容改善。監委調查報告指出，教育部在規畫12年國教制度時，失去原「免試、免學費」精神，造成制度「免非免（試）」、「特非特（招）」的混亂情況。當初教育部規畫12年國教制度，宣稱可讓學生免試升學，並至少在103年免試入學達75％，以減緩學生升學壓力；但因基北區高中職僅釋出25％免試名額，再加上測驗學習情況的「會考」形同聯考筆試，導致「免試」目標無法達成。此外，教育部原規畫免學費政策，但政府因財政困難，而設置排富條款，也讓「免學費」目標跳票。至於與12年國教相應的課綱，教育部預計105年才能審議完畢、107年才能真正實行，讓學生、教師、家長們無所適從。對於北北基政府與教育部為超額比序鬧爭議一事，調查報告也指出，地方政府有權決定免試入學、超額比序方式，教育部僅有「備查」而無「核定」權限；但因教育部訂定「免試入學作業要點」，要求地方遵守，才造成地方政府與中央衝突不斷、權責無法釐清。監委王美玉表示，對於許多家長恐慌的超額比序比較作文分數一事，其實僅基北區實施，但有官員反應，因基北「外溢效應」讓中南部家長、學生相當恐慌。她指出，因北北基的明星學校多，教育部規畫時，本就不可能用一套標準要求各縣市一體適用，「應該因地制宜才對」。，